1957年 第17回日本昆虫学会大会の中で、“日本蜻蛉同好会”を創立（創立会員14名）
1958年 会誌「Tombo Acta Odonatologica No.1」の発行。連絡誌「Pterobosca No.1」の発行
1959年 Tombo, Vol.2, No.1/2 の表紙に初めて会章が付く
1967年 創立10周年を機に、名称を“日本蜻蛉同好会”から“日本蜻蛉学会”に変更することを決定。会長は朝比奈正二郎氏（1997年名誉会長）。
1982年 昭和57年度日本蜻蛉学会集会は、初めての試みとして日本昆虫学会大会とは別個に開催。会場は、長野県小県郡真田町の筑波大学菅平高原実験センター。
1993年 「第12回国際トンボ学会シンポジウム」（大阪国際交流センター他）への後援
1997年 平成9年度日本蜻蛉学会集会にて枝重夫氏が会長に就任（2010年名誉会員，2011年名誉会長）
1998年 自然保護委員会の設置
同年 学会の英語名を“The Japanese Society for Odonatology”、Tomboの副題を“Acta Odonatologica Japonica”に変更
1999年 新生「日本蜻蛉学会大会」を神奈川県立生命の星・地球博物館で開催（全会員に開催案内）
2000年 Pterobosca 6A（復刊記念号）の復刊。1962年のNo.5より休刊していたPteroboscaが37年ぶりに復刊。以後、年2回発行。
2001年 Tombo Vol.43 から編集委員会・査読制度が確立し、学会誌として大きく進展。
2006年 和名検討委員会の設置
同年 日本蜻蛉学会Webページの開設
2008年 会長選挙実施、被推挙者2名
2009年 井上清氏が会長就任（2011年名誉会員）
2011年 松木和雄氏が会長就任
同年 学会名称の表記を「日本蜻蛉学会」から「日本トンボ学会」に変更
同年 「2012年国際トンボ学会議」（主催：WDA・SIO 会場：神奈川県立生命の星・地球博物館）への後援
2014年 会費の自動振り込み（ゆうちょ銀行）の開始
2015年 渡辺賢一氏が会長就任
2016年 年度学会大会名と研究発表要旨集名の統一
2018年 会員に学生会員（高校生以下）を追加
2020年 苅部治紀氏が会長就任
同年 2020年度日本トンボ学会大会（大阪大会）は新型コロナウィルス感染拡大により中止
2021年 2021年度日本トンボ学会大会（大阪大会）を完全オンライン方式で開催。（大阪大会の経験を活かし、2022年度大会 愛知大会・2023年度大会 東京大会は、会場参加とオンライン参加を併用して開催）
2024年 2016年更新から止まっている学会ＨＰを再構築し、新たに学会ＨＰを開設